ARN SRAS-CoV-2 transcrit et intégré dans le génome humain

Une excrétion prolongée d'ARN du SRAS-CoV-2 et une récidive de tests positifs à la PCR ont été largement rapportées chez des patients après guérison, mais ces patients sont le plus souvent non infectieux 1 - 14

Ici, nous avons étudié la possibilité que les ARN du SRAS-CoV-2 puissent être transcrits en sens inverse et intégrés dans le génome humain et que la transcription des séquences intégrées pourrait expliquer les tests positifs à la PCR. 

À l'appui de cette hypothèse, nous avons trouvé des transcrits chimériques constitués de virus fusionnés à des séquences cellulaires dans des ensembles de données publiés de cellules cultivées infectées par le SRAS-CoV-2 et de cellules primaires de patients, compatibles avec la transcription de séquences virales intégrées dans le génome. 

Pour corroborer expérimentalement la possibilité d'une rétro-intégration virale, nous décrivons des preuves que les ARN du SRAS-CoV-2 peuvent être transcrits en sens inverse dans les cellules humaines par transcriptase inverse (RT) à partir d'éléments LINE-1 ou par HIV-1 RT, et que ces ADN les séquences peuvent être intégrées dans le génome cellulaire et être ensuite transcrites.

L'expression endogène humaine de LINE-1 a été induite lors d'une infection par le SRAS-CoV-2 ou par une exposition à des cytokines dans des cellules cultivées, suggérant un mécanisme moléculaire pour la rétro-intégration du SRAS-CoV-2 chez les patients. 

Cette nouvelle caractéristique de l'infection par le SRAS-CoV-2 peut expliquer pourquoi les patients peuvent continuer à produire de l'ARN viral après la guérison et suggère un nouvel aspect de la réplication du virus à ARN.

Liguo Zhang , Alexsia Richards , Andrew Khalil , Emile Wogram , Haiting Ma , Richard A. Young , Rudolf Jaenisch

doi :https://doi.org/10.1101/2020.12.12.422516

Déclaration d'intérêts concurrents

Les auteurs ont déclaré aucun intérêt concurrent.

Source : biorxiv.org

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